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计算机工程 ›› 2010, Vol. 36 ›› Issue (12): 259-261. doi: 10.3969/j.issn.1000-3428.2010.12.090

• 开发研究与设计技术 • 上一篇    下一篇

基于功能的疾病基因预测系统设计与应用

袁 芳1,王瑞春1,管明祥1,周艳红2   

  1. (1. 深圳信息职业技术学院电子通信技术系,深圳 518029;2. 华中科技大学湖北生物信息与分子成像重点实验室,武汉 430074)
  • 出版日期:2010-06-20 发布日期:2010-06-20
  • 作者简介:袁 芳(1977-),女,讲师、博士,主研方向:生物信息学,数据库技术;王瑞春,高级工程师、硕士;管明祥,讲师、博士;周艳红,教授、博士生导师
  • 基金资助:
    国家自然科学基金资助项目(90608020);深圳信息职业技术学院第二批博士创新基金资助项目(BC20090011)

Design and Application of Disease Gene Prediction System Based on Function

YUAN Fang1, WANG Rui-chun1, GUAN Ming-xiang1, ZHOU Yan-hong2   

  1. (1. Department of Electronics and Communications Technology, Shenzhen Insititue of Information Technology, Shenzhen 518029;2. Hubei Bioinformatics and Molecular Imaging Key Laboratory, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074)
  • Online:2010-06-20 Published:2010-06-20

摘要: 针对与某种特定器官组织相关的疾病,利用新基因识别、基因功能预测以及疾病基因预测等技术,提出并实现一个基于基因功能信息的疾病候选基因预测系统。将其用于心血管疾病相关基因的大规模分析与预测,结果证明,该系统可以对疾病候选区间的已知基因进行致病可能性的鉴别,发现新基因,并判定新基因与疾病的相关程度。

关键词: 疾病基, 基因本体, 预测, 心血管

Abstract: Aiming at the diseases related with specific organs or tissues, this paper uses new gene identifying technology, gene function predicting technology and disease gene finding technology to propose and develop a candidate disease gene prediction system based on gene functional information. This system is applied for large-scale analysis and prediction of disease genes involved in cardiovascular, and result proves that the system can identify the known genes in the chromosomal region of interest, find new genes and evaluate the relation degrees of the new genes to the disease.

Key words: disease gene, Gene Ontology(GO), prediction, cardiovascular

中图分类号: